Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRG3P56975 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRG3P56975 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRG3P56975 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRG3P56975 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRG3P56975 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRG3P56975 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRG3P56975 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms