Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PGGT1BP53609 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
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PGGT1BP53609 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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PGGT1BP53609 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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