Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT5P48643 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT5P48643 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT5P48643 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT5P48643 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT5P48643 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT5P48643 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT5P48643 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT5P48643 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT5P48643 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT5P48643 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT5P48643 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT5P48643 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT5P48643 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT5P48643 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT5P48643 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT5P48643 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT5P48643 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT5P48643 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCT5P48643 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCT5P48643 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCT5P48643 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCT5P48643 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT5P48643 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT5P48643 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT5P48643 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT5P48643 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT5P48643 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT5P48643 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT5P48643 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT5P48643 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT5P48643 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT5P48643 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT5P48643 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT5P48643 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT5P48643 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT5P48643 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT5P48643 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT5P48643 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT5P48643 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT5P48643 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT5P48643 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT5P48643 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT5P48643 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT5P48643 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT5P48643 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT5P48643 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT5P48643 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT5P48643 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT5P48643 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT5P48643 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT5P48643 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT5P48643 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT5P48643 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT5P48643 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT5P48643 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT5P48643 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT5P48643 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT5P48643 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT5P48643 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT5P48643 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT5P48643 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT5P48643 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT5P48643 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT5P48643 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT5P48643 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCT5P48643 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT5P48643 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT5P48643 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT5P48643 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCT5P48643 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT5P48643 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT5P48643 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT5P48643 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCT5P48643 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT5P48643 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT5P48643 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT5P48643 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT5P48643 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT5P48643 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT5P48643 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT5P48643 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT5P48643 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT5P48643 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT5P48643 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT5P48643 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT5P48643 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT5P48643 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT5P48643 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT5P48643 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT5P48643 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT5P48643 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms