Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA4P48169 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA4P48169 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA4P48169 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA4P48169 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA4P48169 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA4P48169 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA4P48169 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA4P48169 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA4P48169 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA4P48169 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA4P48169 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA4P48169 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms