Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRATP43155 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRATP43155 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms