Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP2P42575 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP2P42575 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP2P42575 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP2P42575 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP2P42575 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP2P42575 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP2P42575 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP2P42575 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP2P42575 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP2P42575 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP2P42575 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP2P42575 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP2P42575 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP2P42575 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP2P42575 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP2P42575 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP2P42575 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP2P42575 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP2P42575 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP2P42575 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP2P42575 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP2P42575 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP2P42575 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP2P42575 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP2P42575 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP2P42575 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP2P42575 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP2P42575 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP2P42575 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP2P42575 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP2P42575 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP2P42575 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP2P42575 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP2P42575 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP2P42575 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP2P42575 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP2P42575 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP2P42575 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP2P42575 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP2P42575 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP2P42575 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP2P42575 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP2P42575 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP2P42575 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP2P42575 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP2P42575 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP2P42575 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP2P42575 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP2P42575 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP2P42575 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP2P42575 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP2P42575 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP2P42575 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP2P42575 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP2P42575 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP2P42575 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP2P42575 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP2P42575 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP2P42575 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP2P42575 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP2P42575 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP2P42575 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP2P42575 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP2P42575 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms