Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THBS4P35443 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms