Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms