Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHC1P29353 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHC1P29353 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHC1P29353 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHC1P29353 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SHC1P29353 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHC1P29353 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHC1P29353 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHC1P29353 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHC1P29353 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHC1P29353 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHC1P29353 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHC1P29353 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHC1P29353 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHC1P29353 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHC1P29353 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SHC1P29353 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHC1P29353 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHC1P29353 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHC1P29353 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SHC1P29353 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHC1P29353 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHC1P29353 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHC1P29353 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHC1P29353 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHC1P29353 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHC1P29353 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHC1P29353 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHC1P29353 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHC1P29353 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHC1P29353 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHC1P29353 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHC1P29353 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHC1P29353 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHC1P29353 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHC1P29353 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHC1P29353 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHC1P29353 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHC1P29353 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHC1P29353 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHC1P29353 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHC1P29353 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHC1P29353 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHC1P29353 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHC1P29353 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHC1P29353 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHC1P29353 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHC1P29353 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHC1P29353 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHC1P29353 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHC1P29353 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHC1P29353 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHC1P29353 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SHC1P29353 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHC1P29353 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHC1P29353 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHC1P29353 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHC1P29353 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHC1P29353 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHC1P29353 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHC1P29353 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHC1P29353 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHC1P29353 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHC1P29353 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHC1P29353 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHC1P29353 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHC1P29353 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHC1P29353 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SHC1P29353 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHC1P29353 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms