Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
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