Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT1P26358 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms