Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO1P25800 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO1P25800 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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