Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms