Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHCEP18577 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHCEP18577 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHCEP18577 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHCEP18577 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHCEP18577 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHCEP18577 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHCEP18577 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHCEP18577 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHCEP18577 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHCEP18577 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHCEP18577 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHCEP18577 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHCEP18577 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHCEP18577 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHCEP18577 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHCEP18577 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHCEP18577 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHCEP18577 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHCEP18577 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHCEP18577 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHCEP18577 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHCEP18577 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHCEP18577 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHCEP18577 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHCEP18577 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHCEP18577 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHCEP18577 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHCEP18577 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RHCEP18577 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHCEP18577 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHCEP18577 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHCEP18577 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHCEP18577 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHCEP18577 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHCEP18577 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHCEP18577 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHCEP18577 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHCEP18577 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHCEP18577 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHCEP18577 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHCEP18577 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHCEP18577 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHCEP18577 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHCEP18577 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHCEP18577 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHCEP18577 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHCEP18577 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHCEP18577 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHCEP18577 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHCEP18577 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHCEP18577 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHCEP18577 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHCEP18577 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RHCEP18577 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RHCEP18577 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms