Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms