Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB1P16220 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB1P16220 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB1P16220 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB1P16220 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB1P16220 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB1P16220 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB1P16220 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB1P16220 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB1P16220 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB1P16220 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB1P16220 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB1P16220 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB1P16220 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB1P16220 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB1P16220 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB1P16220 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB1P16220 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB1P16220 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB1P16220 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB1P16220 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB1P16220 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB1P16220 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB1P16220 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREB1P16220 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREB1P16220 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB1P16220 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB1P16220 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB1P16220 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB1P16220 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB1P16220 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB1P16220 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB1P16220 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB1P16220 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB1P16220 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB1P16220 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB1P16220 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB1P16220 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB1P16220 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB1P16220 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB1P16220 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB1P16220 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB1P16220 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB1P16220 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB1P16220 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB1P16220 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB1P16220 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB1P16220 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CREB1P16220 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms