Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC192P0DO97 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms