Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms