Protein–RNA interactions for Protein: O15198

SMAD9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD9O15198 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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