Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E9PBE3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E9PBE3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E9PBE3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E9PBE3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E9PBE3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
E9PBE3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
E9PBE3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E9PBE3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E9PBE3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
E9PBE3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E9PBE3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E9PBE3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E9PBE3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E9PBE3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E9PBE3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E9PBE3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
E9PBE3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
E9PBE3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E9PBE3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E9PBE3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E9PBE3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E9PBE3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E9PBE3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E9PBE3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E9PBE3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E9PBE3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E9PBE3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E9PBE3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E9PBE3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E9PBE3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E9PBE3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E9PBE3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E9PBE3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E9PBE3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
E9PBE3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms