Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms