Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms