Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms