Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms