Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms