Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR1DQ9Y2S0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR1DQ9Y2S0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR1DQ9Y2S0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR1DQ9Y2S0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR1DQ9Y2S0 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR1DQ9Y2S0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR1DQ9Y2S0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR1DQ9Y2S0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms