Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC5Q9UQL6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC5Q9UQL6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC5Q9UQL6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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