Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms