Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CROTQ9UKG9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms