Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms