Protein–RNA interactions for Protein: Q9P278

FNIP2, Folliculin-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNIP2Q9P278 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNIP2Q9P278 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms