Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms