Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms