Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM53CQ9NYF3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms