Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

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Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTBP3Q9NS15 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTBP3Q9NS15 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTBP3Q9NS15 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTBP3Q9NS15 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTBP3Q9NS15 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LTBP3Q9NS15 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LTBP3Q9NS15 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LTBP3Q9NS15 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
LTBP3Q9NS15 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LTBP3Q9NS15 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LTBP3Q9NS15 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LTBP3Q9NS15 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LTBP3Q9NS15 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBP3Q9NS15 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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