Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ31

AKIP1, A-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKIP1Q9NQ31 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AKIP1Q9NQ31 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms