Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED4Q9NPJ6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms