Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms