Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms