Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms