Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDC1Q9BTX1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDC1Q9BTX1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDC1Q9BTX1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDC1Q9BTX1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDC1Q9BTX1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NDC1Q9BTX1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDC1Q9BTX1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDC1Q9BTX1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NDC1Q9BTX1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDC1Q9BTX1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDC1Q9BTX1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDC1Q9BTX1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NDC1Q9BTX1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDC1Q9BTX1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDC1Q9BTX1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDC1Q9BTX1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDC1Q9BTX1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDC1Q9BTX1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDC1Q9BTX1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDC1Q9BTX1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDC1Q9BTX1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDC1Q9BTX1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDC1Q9BTX1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDC1Q9BTX1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDC1Q9BTX1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDC1Q9BTX1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDC1Q9BTX1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDC1Q9BTX1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDC1Q9BTX1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDC1Q9BTX1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms