Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms