Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS1Q99742 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms