Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms