Protein–RNA interactions for Protein: Q96QH2

PRAM1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAM1Q96QH2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAM1Q96QH2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAM1Q96QH2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAM1Q96QH2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAM1Q96QH2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAM1Q96QH2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAM1Q96QH2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAM1Q96QH2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAM1Q96QH2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAM1Q96QH2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAM1Q96QH2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAM1Q96QH2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAM1Q96QH2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAM1Q96QH2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRAM1Q96QH2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRAM1Q96QH2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRAM1Q96QH2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRAM1Q96QH2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAM1Q96QH2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms