Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms