Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB9

PGLYRP3, Peptidoglycan recognition protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP3Q96LB9 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGLYRP3Q96LB9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms