Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms