Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms