Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms